Organskega ogljika, ki tvori biološko črpalko prenaša predvsem z potopu delcev materiala, na primer mrtvih organizmov (vključno s alg preproge) ali fecesa peletov. Pa nekaj ogljika doseže globoko ocean kot raztopljenega organskega ogljika (DOC) s fizičnim prevozom procesi, kot so downwelling, namesto da potopu. Ogljika črpalko.