Proces, s katerim transposon ali vstavljanje zaporedje sama vstavi v novo mesto na isti ali drugi molekule DNK. Točen mehanizem še ni povsem razjasnjena in različnih Transpozone lahko prenesejo z različnimi mehanizmi. Prenos v bakterije ne zahteva obsežnih homologija DNA med v transposon in ciljno DNK. Fenomen je zato opisan kot nezakonski rekombinacije.