En plasmid kan replikera i två olika värdorganismer eftersom det bär två olika ursprung av replikering och kan därför användas för att "Transfer" gener från den ena till den andra. Till exempel Japp, pJDB219, är en shuttle vektor kunna replikera i E. coli från pMB9 ursprung och i Saccaromyces cerevisiae från 2 µm-plasmid ursprung.