En teknik som identifierar överlappande klonade DNA fragment som bildar en kontinuerlig segment av en kromosom. Dessa fragment kan genereras genom slumpmässiga klippning eller partiell uppslutning med en fyra-baspar fräs som Sau 3A. En serie av kolonin hybridizations genomförs sedan, börjar med några klonade fragment som redan har identifierats och som är kända för att vara i regionen omfattas av överlappande klonerna. Detta identifierade fragment används som en sond att plocka ut kloner som innehåller intilliggande sekvenser. Dessa används sedan som sonder sig för att identifiera kloner som transporterar sekvenser intill dem och så vidare. På varje runda av hybridisering en "promenader" vidare längs kromosomen från första fragmentet.