En polypeptid av ett rekombinant gen som innehåller delar av två eller flera olika gener. De olika gener är kopplade så att deras kodande sekvenser är i samma behandlingen ram: genetiska utrustningen läser gen fusion som en enda gen, och så producerar ett protein som fusion. Kallas även hybrid protein eller chimär protein. Dessa proteiner används:

-till affinitet tagg till ett protein,

-att producera en peptid som en del av ett större protein, som skärs sedan upp efter det har gjorts genom kloning;

-att framställa ett protein med två naturliga proteiner, eller

- att tillverka ett protein där två olika aktiviteter är fysiskt kopplade kombinerade egenskaper.