En analysmetod för att separera molekyler beroende på deras storlek. Prover sätts i ena änden av en platta av polymer gel, ett elektriskt fält över gelen drar molekyler genom det, mindre molekyler passera lättare och så gå mot andra änden snabbare, olika storlekar av molekyler som hamnar på olika positioner enligt deras storlek. Geler är gjorda av olika material.

Olika kemikalier kan inkluderas i gelen hjälpa separation, som den rengöringsmedel dodecyl natriumsulfat (SDS) i protein geler att veckla upp proteiner eller urea i DNA sekvensering geler, som utspelar sig DNA.