En uppsättning av tre nulecotides där det finns ingen motsvarande tRNA molekyl att infoga en aminosyra i polypeptid kedjan. Protein syntes därför avslutas och den avslutade polypeptiden frigörs från Ribosomen. Tre stop kodon finns: UAA (ockra), UAG (gul) och UGA (opal). Mutationer som ger någon av dessa tre kodon i en position som normalt innehåller en codon anger en aminosyra som kallas nonsens mutationer. Stop kodon kan också kallas nonsens kodon.