ஒரு குறிப்பிட்ட வரிசை எ.கா., Bam H1 அறிவதை பின்னர் டிஎன்ஏ cleaves என்று, endonucleases வகுப்பு (5´GGATCC3´), சுற்றுச்சூழல் RI (5´GAATTC3´), மற்றும் சில dIII (5´AAGCTT3´). வரையறை endonuclease செரிக்கும் மூன்று வகைகள் உள்ளன:

வகை I: தூரம் அல்லாத-குறிப்பாக அதன் அங்கீகாரம் வரிசை முறை இருந்து 1000 இரத்த அழுத்த அதிகமாக வெட்டி மற்றும் வரையறை மற்றும் methylation செயற்பாடுகள் உள்ளன.

வகை II: நிராகரித்தார் at அல்லது அருகே ஒரு குறுகிய மற்றும் பெரும்பாலும் palindromic (q.v.), அங்கீகாரம் வரிசை முறை. A தனி நொதி அதே அறிதல் வரிசை முறை methylates. அவர்கள் இருக்கலாம் என்பதை சரியாக படத்தில் வேறு இரண்டு டிஎன்ஏ strands உள்ள நிராகரித்தார் மற்றும் blunt உருவாக்க முடிகிறது, அல்லது அவர்கள் ஒட்டு முடிவடைந்தவுடன் உருவாக்க staggered நிராகரித்தார் செய்ய நேரிடலாம். இரண்டாம் வகை வரையறை செரிக்கும் பொதுவாகப் பயன்படுத்தும் வாய்ப்புள்ள உள்ள டி.என்.ஏ தொழில் நுட்பம் ஒன்றை உள்ளன.

வகை III: இரத்த 24-26 அழுத்த downstream இருந்து ஒரு குறுகிய, asymmetrical அங்கீகாரம் வரிசை முறை வெட்டி. ATP தேவைப்படுகிறது மற்றும் வரையறை மற்றும் methylation கொண்டுள்ளது.