วิธีการในการแยกกรดนิวคลีอิกหรือโมเลกุลโปรตีนตามขนาดโมเลกุล ย้ายโมเลกุลผ่านเมทริกซ์ inert เจลภายใต้อิทธิพลของสนามไฟฟ้า ในกรณีที่โปรตีนหน้า ผงซักฟอกเช่นโซเดียมซัลเฟต dodecyl (SDS) มักจะเพิ่มเพื่อให้แน่ใจว่า โมเลกุลทั้งหมดมีค่าสม่ำเสมอ โครงสร้าง รองบ่อยอาจทำให้การโยกย้าย anomalous ของโมเลกุล ทั่วไป denature โปรตีนตัวอย่าง โดยให้เดือดก่อนหน้าดังนั้น ในกรณีของกรดนิวคลีอิก denaturing ตัวแทนเช่นไฮดรอกไซด์ mercuric formamide ยูเรีย หรือ methyl มักจะรวมเข้าไปในเจลเอง ซึ่งอาจยังทำงานที่อุณหภูมิสูง หน้าใช้แยกผลิตภัณฑ์ของปฏิกิริยาลำดับดีเอ็นเอ และเจทำงานอยู่สูง denaturing เนื่องจากโมเลกุลที่แตกต่างกันในขนาด โดยนิวคลีโอไทด์หนึ่งต้องได้รับการแก้ไข