Hangi DNA dizisi sabit olan bir küçük cam yüzey parçaları, her biri tanımlanmış bir yerde. A tipik DNA çip sadece birkaç santimetre kare bir alanda 10 000 ayrık noktalar (her farklı bir DNA parçası içeren) içerir. Ne zaman bir çözüm fluorescently etiketli DNA parçalarının çipi melezleşmiştir, hibridizasyon oluştuğu noktalar Floresans görünür. Eğer çip üzerindeki noktalar genlerin (sıra Etiketler, ifade q.v.), hibridizasyon cDNA sayfasından belirli bir doku ile gösterir hangi genlerin bu doku ifade edilir. Lekeler kısa, eğer sentezlenen oligonucleotides (yaklaşık 25 bazlar) karşılık gelen bir kısmının bir gen içeren bir tek nükleotid polimorfizmleri (SNP)(q.v.), her 4 olası üsleri, bu sitede, bir bitki veya hayvan sağlar olarak birçok genotyped de olmak bireysel olarak SNP loci çipte gösterilmesini genomik DNA hibridizasyon için ayrı bir yer ile. Büyük avantaj DNA fiş için Genotipleme süreci, böylece çok sayıda bitki veya hayvan çok sayıda loci genotyped olmak için etkinleştirme otomatik olabilir ölçüde olduğu.