Bilinmeyen bir bölgede bir kromozom keşfedilmeyi bir teknik. Genellikle ilgi odağı olan hiçbir soruşturma mevcuttur, ama tespit ve klonlanmış bir gen bağlantılı olarak bilinen ayırmak için kullanılır. Bilinen bir genin seçilir ve hangi aynı gen içeren diğer çakışan tanımlamak için bir soruşturma parçaları olarak kullanılan içeren bir parçası . Bu parçaları dizilerinin ardından ile karakterize nükleotit . Kromozom uzunluğunu için bu işleme devam eder.