Özellikle 5´ mononucleotides tek iplikçikli DNA veya RNA aşağılar bir enzim. Saf ipliksi mantar Aspergillus oryzae, S ₁ nükleaz unpaired bölgeler kaldırarak hibridizasyon reaksiyon ölçüde değerlendirmede kullanılır. Da kısıtlama parçaları yapışkan uçlarını kaldırmak için kullanılır. Eşleme, S, ₁ bir genin kodlama bölgesinin mRNA DNA hibridizasyon gerçekleştirme ve unpaired DNA ile S ₁ nükleaz kaldırarak algılandı.