Бактеріальні, грибкові або водоростей мікроорганізм випадково заходу на культури чи культурального середовища. Забруднювача може виростати рослинних клітин і таким чином перешкоджають їх зростання. Роботу в асептичних умовах з строгих виключення потенційних забруднювачів необхідно буде практикуватися в культурі тканин рослин.