Một gen mà có thể được đặt ở khu vực tương tự như một điểm đánh dấu DNA đã được chứng minh để được liên kết đến một đặc điểm quỹ tích đơn hoặc để một locus đặc điểm định lượng (QTL), nơi các gen có thể vị trí trong bộ gen của các loài trong câu hỏi dựa trên vị trí của nó được biết đến trong bản đồ của một loài, tức là, dựa trên bản đồ so sánh giữa hai loài.