Huỳnh quang trong situ lai của DNA từ một loài trên nhiễm sắc thể metaphase của một loài. Thông thường, sự lai ghép được thực hiện một cách riêng biệt cho DNA thư viện đại diện cho mỗi nhiễm sắc thể. Kết quả là một hình ảnh hấp dẫn trong vùng của nhiễm sắc thể tương đồng giữa loài.