Một phương pháp phân tích để tách các phân tử theo kích thước của chúng. Mẫu được đặt ở một đầu của một tấm polymer gel; một điện trường trên gel kéo các phân tử thông qua đó các phân tử nhỏ hơn vượt qua dễ dàng hơn và do đó di chuyển về phía bên kia nhanh hơn; kích cỡ khác nhau của các phân tử kết thúc tại vị trí khác nhau theo kích thước của chúng. Gel được làm từ vật liệu khác nhau.

Các hóa chất có thể được bao gồm trong gel để giúp tách, chẳng hạn như chất tẩy rửa natri dodecyl sunfat (dùng mũi SDS) trong protein gel để mở ra các protein, hoặc urê trong trình tự DNA hình gel, mà mở ra DNA.