Bất kỳ gen có sự hiện diện có thể dễ dàng phát hiện bởi biểu hiện phenotypic của nó và được sử dụng để xác định vị trí các gen. Cũng phát hiện RFLP được sử dụng để xác định một gen được liên kết cụ thể hoặc một cá nhân mang một gen quan tâm.