Một đa hình (cuộc) tại một trang web cơ sở cụ thể trong một chuỗi mã hóa, ví dụ, tại căn cứ 306 trong một gen cụ thể, một cá nhân có thể được hổ cho A và G: allele bà mẹ có thể có một A tại trang web này, trong khi nội alen có một G tại trang web này. Loại đa hình là rộng rãi trên toàn bộ gen, và có lợi thế lớn của được phát hiện mà không cần điện gel, mở đường cho tự động hóa quy mô lớn trong gen.