一个术语用来描述任何过程或行为在定义序列，在一个 DNA 或 RNA 分子内的酶。第二类限制酶是特定于站点内切酶和的重组系统由一些转座子编码是特定于站点，如是入噬菌体的集成 E.大肠杆菌 染色体。