类型二、 限制性内切酶将绑定 （并且随后军风） 站点上包含六个核苷酸对的序列是唯一地识别该酶的 DNA。由于六个基地的任何序列发生频率较低的机会比任何的四个碱基序列，六个基地刀劈成较少比四个基地刀具。因此，六个基地刀具创建较大的碎片比四基地刀具。