其中一個小的 DNA 分子 （通常通過同源重組) 插入一個大重組過程。如果分子是迴圈的集成涉及到只有單一的橫穿 ； 如果線性的則需要兩個過境點以上。一個眾所周知的例子是的噬菌體 λ （lambda） DNA 整合入 E.大腸桿菌 基因組。