具體會降低到 5´ 核苷酸的單鏈 DNA 或 RNA 酶。純絲狀真菌 米麯黴、 S ₁ 核酸酶用於通過移除不成對的地區評估雜交反應的程度。它還用於刪除限制片段的粘性末端的 。在 S ₁ 映射，一個基因的編碼區是通過執行 mRNA DNA 雜交和刪除不成對的 DNA 與 S ₁ 核酸酶檢測到。