核苷酸序列-4、 6 或 8 核苷酸-通常由組成，得到承認，並對限制性內切酶 （限制酶） 綁定的。類型 II 限制性內切酶 （那些用於基因的克隆實驗） 也是內酶具體削減 （和其相應的酶 methylate） 的序列 DNA，即為類型 II 酶，識別網站和目標網站都相同的序列。型酶將綁定到其識別網站，然後劈成的一些更多或更少的隨機位置的識別網站外的 DNA。